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为什么序列认为他们是如此特别?

如今的编程培养雷竞技app官网由丹尼斯·沃特斯赞助。目前,他担任劳伦斯小镇,新泽西当他不靠近树干或墓碑采集地衣蹲的历史。他创立GenomeWeb.com,新闻网站和出版商的分子生物学家,1997年仍担任其董事长。他也有被我父亲的特权。按照他的Twitter @dpwaters。

我在这里敷衍了事*促进一本新书,包括我的博士生导师,霍华德Pattee的经典论文十七岁。这本书,叫做法律,语言和生活,是Pattee本人,以及到他80共同编辑和锋利如初,并通过neurolinguist和Pattee学者乔安娜R'的czaszek,莱奥纳尔迪华沙大学。

但是,而不是要求你购买它,我将使用这本书的出版完全显着的机会全心全意督促你去阅读一些Pattee的任何形式,你可以找到。

为什么读Pattee?

好了,我们知道生活的世界依赖于核酸序列它的存在和持续运行。我们也知道,人类进化到创建,处理能力和复制的声序列,后来这些序列承诺书写的更持久的媒介。最后,我们知道我们的先进技术文明越来越依赖于存储,移动和处理位零和一的字符串序列。

那么,什么是它与 sequenCES

这是本质上的问题Pattee已经过去50年的研究。

Pattee训练作为斯坦福大学物理学家和仍然写关于生物学(和大脑)与苛刻的精度。该拼图他关心符号序列的物理性质和全身功能的问题。 Pattee与传统生物学和认知科学回答这些问题的抱怨是,我们永远无法理解人脑的高级用序列而不会首先在一个简单得多的层次了解其性质和功能。

[123 ]

这是Pattee的内心讲物理学家:为什么建模一个复杂的系统时,你可以模拟一个简单的?因此,他对日的进化起源搜索是问题。正如他在他1969年的论文(论文#2书)“如何做一个分子成为信息?”:

我相信生命起源的问题,甚至不能配方中不含更好地了解分子如何能象征性地发挥作用,也就是说,是记录,编码和信号。或者,正如我在我的标题所暗示的,了解的起源,我们需要知道分子是如何成为一条讯息。

更具体而言,作为一个物理学家,我想知道如何区分[ 123]从正常物理通信

分子间的相互作用或力,我们认为帐户管理所有的运动分子之间。此外,我需要进行这种区分在最简单可行的水平,因为它没有回答这个起源问题1到一下高度发展的生物,其中通信过程是相当清楚的和不同的。因此,我需要知道的消息是如何起源。 (强调他)

“消息”意味着“序列”,所以他的问题集中在物理系统是如何每天改变自己的行为时,分子变顺序进行组织。如果我们能够开始应付这个问题,那么也许我们的理解如何其他序列为基础的系统(如语言)功能一个战斗的机会。

这样,在电池成为他的点出发各级了解序列。下面是他如何把它放在他的1982的论文“细胞心理学:一种渐进的方法,以符号事项问题”(#10在书):

高层次的概念,如意图,意义,思想,等等,这是我们与心中唯一的关联,必须有一个或多或少的渐进序列进化的前体。问题是,我们没有什么简单的“用心”,“义”或“思想”看起来像一个明确的概念。这是因为心理历来只高度进化的“精神”活动的定义,因此,即使我们在细胞甚至分子水平研究大脑,有默契的信念,没有真正的心理可以在一个简单的层面上存在。[123 ]

人体生理学也首先被定义为总器官和体液的研究,但渐渐地,这些概念进行了概括和提炼的简单生物的研究,直到今天,我们发现人体生理学基础的细胞生理学。这确实ñOT意味着细胞解释或表现出所有更高级别的过程。细胞没有脚和耳朵,但他们有动力和烦躁,这是脚和耳朵的基本功能。...

我认为,大脑级心理学不太可能收敛,直至我们对细胞心理学的基础达成某种协议。很显然,我不是建议细胞有任何的思想多细胞有脚,但细胞是肯定希望它能够更清楚地理解和模拟物符号系统。

当Pattee验看“就事论事在细胞中的符号系统”,他自然集中于遗传密码的序列。我们能找到一种原则的方式核酸序列的两个互补的角色之间的区别?在一方面,他们表现得像普通分子,形成债券和做所有的合法的事情,分子可以做到。在另一方面,其在生物系统的功能是充当模板以“连通”如何构建的氨基酸序列,并最终蛋白质的三级结构。

[ 123]

据我们了解,他们的

一般

的行为是由物理定律控制。但我们也明白,没有物理定律,说的基因序列必须正好是他们的序列;替代序列是容易想象。换句话说,生物学可能与通用实物一致

法律

,但生物的有趣的基于序列的行为取决于什么Pattee调用特定的任意规则。对于未经训练的é你们这些规则可能看起来像法律,但他们不是。作为Pattee解释在他1978年的论文“补充性原则在生物和社会结构”(#8在书中,他的第一篇论文是我读过): 之间的基本区别法律和规则可以由这些标准进行:法律是(a)必然

,(b)

无体

和(c)普遍;规则是:(a)任意,(B)结构依赖性和(c)本地。换句话说,我们不能改变或逃避的自然规律;我们总是可以回避或改变规则。自然法则不需要实施方式或结构来执行它们;规则必须有一个真正的物理结构或约束,如果他们要执行。最后,法律保持在任何时候,任何地方; RULES只存在何时何地有执行它们的物理结构。 (强调他) 正如你无疑有注意到,Pattee很难在一个简短的文章来概括。他从未停止过要求在生物学中的“大问题”,所以你不应该看他期待简单的答案。相反,你应该想到的,将满足工作的物理学家(虽然非常不从还原论的角度)解释冒充这些经典的困惑,用不懈的坚持的全新方式。您将受益于这些“大问题” - 和成反比你与它们是如何回答的最新的满意度读数成正比Pattee自己的兴趣。

随着Pattee,答案躲避,但问题得到改善。

的理论生物学,认知科学,人工生命等论文Pattee的踪迹可以追溯到20世纪60年代的新书的出版完全是显着的,因为,尽管在所有这些decades-的生产这种大型机构的工作Pattee也没写过任何接近本书的篇幅。 1973年,他编辑了广泛关注集合

层次理论

,但仅此而已。自那时以来的40年里,一切是论文,论文,论文。 (包括他最新出版就在上个月。)

这是一种享受,看到这么多的好的终于收集和可用的,但不幸的是在包仅在预算范围机构库。但它不能伤害到你的上访库得到一份拷贝。请。同时,去和读一点Pattee。在谷歌学术几秒钟不会让你失望。

我现在返回到您的定期博客。谢谢你,亲爱的。

*我说“敷衍了事促进”的原因是,与旨在窄太多的技术书籍发生市场,出版商正在充电一笔不小的它。所以,我不会劝你放弃你正在做什么,然后花$ 159一书的人,你可能从未听说过的

图片1:手稿从页面哥白尼的

天体运行论

图2:DNA链通过迈克尔抚摩

关于作者(S)[ 123]

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